标签归档:生物信息

COS沙龙第37期(北京)纪要

主题:癌症液体活检简介

嘉宾:颜林林

主办:统计之都

场地:北京大学

组织:吕翔  魏太云  高涛  于嘉傲  杨舒仪

纪要:于嘉傲

简介:第37期沙龙(北京)于2016年4月17日在北京大学顺利举办。本次沙龙由人大统院本科生杨舒仪主持,沙龙主讲人颜林林,本科毕业于厦门大学生命科学学院生物专业,现为北京大学生命科学学院生物信息专业博士研究生,研究方向为人类基因组学中的高通量测序技术应用及数据分析。拥有十多年软件开发项目实战经验,涉足视频点播、图像处理、数据库信息系统、网络安防等多个领域,技术上擅长C/C++语言编程。崇尚开源,故对Linux、R语言等都比较热衷。

液体活检,即从血液等体液中提取癌细胞DNA,用以获得癌症相关信息的检测技术。由于其无创伤和高灵敏等特点,近年来被众多公司和机构热捧,被誉为“癌症诊断领域的颠覆性技术”。本次沙龙颜林林介绍了液体活检的基本原理及当前进展,并从生物信息学和统计学的角度,阐述该领域现在面临的诸多问题,以及作为非医学专业人士,如何利用大数据技术,共同参与到这场人类与癌症持续了几十年的战争中来。

下面是对沙龙主要内容的回顾: 继续阅读COS沙龙第37期(北京)纪要

COS访谈第十二期:Terry Speed教授,2013年总理科学奖得主

【COS编辑部按】本译文原文来自澳大利亚Science in Public,讲 述Terry Speed,一位著作等身的统计学者,对学术和社会生活的热情;原文版权归 Science in Public所有。本文译者:尤晓斌(新加坡国立大学);审校:李妙竹(上海生科院)、施涛(The Ohio State University)。

“统计学本来就应该成就其他学科,我太爱统计了,它像把钥匙一样让我们能溜进任何学科的后院里随便玩耍”

—Terry Speed

alt

图1 Terry Speed

 

用数字同癌症抗争

Terry Speed从不觉得能很快在媒体的头条上看到类似“统计学家治愈癌症”的标题,不过他坚信数学和统计学可以有效地帮助研究者认识癌症背后的诱因,从而减少手术的需要。身兼数学家和统计学家,Terry笔下诞生了不少鲜有人读得懂的精美学术著作,但除此之外,他还有学术成就以外的另一面,他曾出席法庭作证,帮助农户和采钻矿工,还为生物学家提供统计工具以解决基因的进化问题。

20年前,生物学家们只能孤立的研究一两个基因。而今,他们已经能够同时跟踪同一个细胞里的上千个基因,但若想真正理解这些信息,得到他们想要的结果,生物学家们就还需要运用Terry提出的统计方法。

当Terry年近古稀,他专注于挑选正常细胞与癌细胞不同之处,更加接近有效治疗癌症的临床研究,并同业界一同合作研发检测甲状腺细胞增殖是否发生癌变的工具。

因其在解释基因组的解释以及相关技术的研发做出的杰出贡献,这位WEHI医学研究所生物信息学领头人荣获2013年总理科学奖(Prime Minister’s Prizes for Science)继续阅读COS访谈第十二期:Terry Speed教授,2013年总理科学奖得主